2021年3月31日，经中国证监会同意，深交所发布两板合并业务通知及相关规则，明确合并实施后的相关安排，于4月6日正式实施两板合并。在两板合并业务规则整合过程中，深交所对交易规则、融资融券交易实施细则、高送转指引等7件规则进行了适应性修订，并废止《关于在部分保荐机构试行持续督导专员制度的通知》等2件通知，主要涉及删除中小板相关表述、统一高送转定义、调整相关交易指标计算基准指数、取消持续督导专员制度等。上述调整安排于4月6日两板合并实施时生效，其主要调整的内容为：
关于证券类别。原中小板上市公司的证券类别变更为“主板A股”，证券代码和证券简称保持不变。在原中小板申请上市的企业已提交的发行申请文件的“中小板”字样视同为“主板”。
关于证券代码区间。原中小板“002001-004999”证券代码区间由主板使用，主板A股代码区间调整为“000001-004999”。
关于指数调整。根据深交所与深圳证券信息有限公司2021年2月5日发布的《关于调整中小板指等指数名称的公告》的安排，原中小板指数、中小板综合指数、中小板300指数等指数的名称调整自合并正式实施日起生效。
关于行情展示。相关单位在技术系统的交易、行情展示等前端界面不再设置中小板股票专区。